Praktikum beim EMBL =]
In meinen letzten 2 Wochen der Sommerferien mache ich ein Praktikum beim EMBL. Die erste Woche davon war letzte Woche, die nächste Woche wird die zweite werden.
Ich arbeite in der GeneCore-Abteilung und vergleiche verschiedene (kommerzielle und open-source / freie) Programme zur Analyse von riesigen Mengen (we’re talking ~1 TB per run) von RNA-Seq-Daten mit dem Ziel, am Ende eine “beste Lösung” für jedes Anwendungsgebiet zu haben.
Dabei habe ich gemerkt, wie verdammt wichtig eine gute Dokumentation ist. Das Forschungsfeld um RNA-Seq ist noch sehr jung und daher steckt auch die Software noch in den Kinderschuhen. Es ist aber teilweise wirklich unglaublich, wie schlecht Teile der Software dokumentiert sind und wie viel Zeit nur dafür draufgeht, Parameter und mögliche Interferenzen zu “erraten”…
Für mich als Schüler ist die Schnellebigkeit dieses Forschungsfeldes einfach der pure Wahnsinn. Papers zu neuen Erkenntnissen schießen wie Pilze aus dem Boden und referenzieren andere Schriften, die teilweise erst vor unter einem Monat veröffentlicht wurden. Zum Vergleich: In der Schule haben wir in manchen Fächern über 20 Jahre alte Bücher…